La Fiscalia Anticorrupció ha recorregut la decisió de la jutge Mercedes Alaya de no dividir el cas dels ERO en peces separades i ha advertit que si no es fa aquesta divisió, que ja han demanat en altres ocasions, la instrucció s'allargarà sine die i hi haurà aspectes que no podran ser enjudiciats. En el seu recurs d'apel·lació, la Fiscalia diu que en no dividir la causa es provocarà un retard en la conclusió de la instrucció sine die i també suposarà "admetre que algunes d'aquestes peces no podran ser jutjades o per manca de recursos en la instrucció o per prescripció dels fets". Anticorrupció afirma que la instrucció d'Alaya, que va començar el gener del 2011, s'ha "traduït en una macrocausa d'extensió temporal, subjectiva i material pràcticament inabastable", cosa que atribueixen a "la pròpia realitat dels fets d'aparença delictiva que són objecte d'investigació".