La creixent especialització de l'Hospital de Cerdanya en la medicina de l'esport i la muntanya, que és hereva de la que va iniciar el seu predecessor Hospital de Puigcerdà, l'ha conduït a esdevenir centre mèdic de referència en l'esport català.

Per les seves instal·lacions hi passen esportistes del programa d'Alt Rendiment Esportiu de Catalu-nya (ARC) per sotmetre's a tot tipus de revisions, com ara proves d'esforç de màximes bàsiques de salut i anàlisi de gasos, per conèixer-ne el rendiment tant en bicicleta estàtica com en tapís rodant; estudis antropomètrics, revisions i consultes mèdiques esportives o ecografies cardíaques. També s'hi fan seguiments d'esportistes o clubs locals i comarcals com ara el Club de Futbol Puigcerdà, Club Patinatge Bellver, Club Patinatge Gel Puigcerdà, el CEFUC o Club Tribike Trainer Andorra o dels esportistes dels Centres de Tecnificació (CT) de la Cerdanya, el Ripollès i l'Alt Urgell.